Finansowo niezależna część organizacji zawierająca jednostki takie jak działy, warsztaty, magazyny oraz projekty. Wszystkie obiekty (jednostki) należące do jednostki organizacyjnej muszą należeć do tej samej firmy logistycznej. Sama firma logistyczna może zawierać wiele jednostek organizacyjnych. Jednostka organizacyjna jest połączona z jedną firmą finansową.
Podczas wykonywania operacji logistycznych pomiędzy jednostkami organizacyjnymi operacje te są księgowane w firmach finansowych, z którymi połączona jest każda jednostka organizacyjna.